第一类是由牙齿病变引起的疼痛，这类疼痛一般比较剧烈，有时甚至会出现发热症状，当遇到冷热刺激后容易出现疼痛加剧的情况，这类牙痛称为牙源性疼痛。引起牙源性疼痛的疾病常见有龋病、牙髓病、根尖周病、牙周病、冠周炎等，一般容易明确诊断。
第二类是由口腔周围的神经、肌肉、关节病变或是全身疾病引起的牙痛，称为非牙源性牙痛。这类牙痛通常没有诱发因素，是自发性的牙疼，对冷热刺激不敏感，呈现区域性牙痛，不会累及全口腔；牙痛时间表现出持续性、周期性，且性质不变。特别是临床检查不能发现病灶牙，常规牙科治疗不能缓解疼痛。
非牙源性牙痛包括由上颌窦、颞下颌关节、眼、耳、鼻、唾液腺等邻近器官病变所引起的牙痛症状；神经性疼痛，如三叉神经痛、蝶腭神经痛、舌咽神经痛；全身性疾病，如糖尿病、心脏病、癔症等引起的牙痛。